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伦理电影在线观看 染色质免疫千里淀(CHIP)现实期间先容
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伦理电影在线观看 染色质免疫千里淀(CHIP)现实期间先容
发布日期:2025-07-02 23:07    点击次数:51

伦理电影在线观看 染色质免疫千里淀(CHIP)现实期间先容

一、期间轮廓伦理电影在线观看

染色质免疫千里淀(Chromatin Immunoprecipitation,简称CHIP)是一种强有劲的分子生物学期间,是检测转录因子等卵白与DNA之间互相作用的主要现实活动之一。通过该期间,不错深入揭示基因调控机制,为转录调控汇集的商榷提供环节数据守旧。

二、现实见识

本次现实以HIF1A卵白为商榷对象,应用CHIP期间连合qPCR检测,考证其是否与筹备运转子区域衔尾偏激衔尾位点,揭示其在转录调控中的环节作用。

三、现实经由

1. 细胞交联

a. 用1ml PBS重悬细胞;

b. 加28ul 37%甲醛(终浓度为1%)进行交联,室温翻转孵育10min;

c. 加入10×甘氨酸至终浓度为1×;室温翻转孵育5min,拆开交联;

d. 4℃,3000g,离心5min;弃上清液;

e. 用1ml预冷的1X PBS重悬细胞,用3000g,4℃,离心5min,去上清;

f. 重叠e关节一遍(此关节千里淀可冻存于-80℃);

2. 胞核制备和染色质毁坏

a. 用200ul Membrane Extraction Buffer(使用前加入2ul卵白酶/磷酸酶扼制剂)重悬细胞;冰上静置10min;

b. 4℃,9000g,离心3min;弃上清液;

d. 用200ul MNase Digestion Buffer (使用前加入0.2ul DTT)重悬细胞核;

d. 加入0.2ul MNase ,奏乐混匀;37℃水浴15min,期间5min混匀一次;

e. 加入20μL MNase Stop Solution;混匀后冰上甩掉5min;

f. 4℃,9000g,离心5min;弃上清液;

g. 用500μL of 1X IP Dilution Buffer(使用前加入5ul卵白酶/磷酸酶扼制剂)重悬千里淀;

h. 冰上超声打断5次,每次2min;(超2s,停4s)

i. 4℃,9000g离心5min;颐养上清到新的EP管中

3. 免疫千里淀

a. 取220ul上清手脚input,-20℃冻存备用;

b. 隔离取220ul上清到两个新的EP管中,标记为IP与IgG; IP组加入10ug见识抗体(或10ul阳性抗体);阴性对照组加入2μL IgG ;

c. 样本管放到翻转仪4℃翻转孵育过夜;

d. 轰动混匀Protein A/G磁珠,隔离加20ul磁珠到IP与IgG组中;

e. 样本管放到翻转仪4℃翻转孵育2h;

f. 将样品置于磁力架上,静置2min进行磁性分离,弃上清;

g. 加入1ml IP Wash Buffer,欧美性交并奏乐混匀;置于翻转仪上,洗涤5min;

h. 将样品置于磁力架上,静置2min进行磁性分离,弃上清;

i. 重叠关节g~h 2次,即共洗涤3次;

j. 加入1ml IP Wash Buffer 2,并奏乐混匀;置于翻转仪上,洗涤5min;

k. 将样品置于磁力架上,静置2min进行磁性分离,弃上清;

4. 洗脱

a. 加入150ul 1X IP Elution Buffer重悬磁珠,65℃轰动孵育30min;(淌若无法轰动孵育,则65℃水浴40min;并每10min混匀一次)

b. 将样品置于磁力架上,静置2min进行磁性分离,将上清颐养到一个新的EP管中;

c. input样本中加入150ul 1X IP Elution Buffer;

d. 千般本均隔离加入6μL NaCl(5M) 、2μL 卵白酶K(20mg/Ml);

e. 奏乐混匀,65℃孵育1.5h;

f. 每样本加入750μL DNA Binding Buffer,奏乐混匀;

g. 吸500ul样本到DNA Clean-Up Column;室温10,000 × g 离心1 min;

h.弃滤液,把剩余的样本加入到DNA Clean-Up Column;室温10,000 × g 离心1 min;

i. 弃滤液,加入750ul DNA Column Wash Buffer;室温10,000 × g 离心1 min;

j. 弃滤液,把吸附柱从头放回网罗管,室温10,000 × g 离心2min;

k. 将吸附柱颐养到一个新的1.5ml EP管中,加入50μL DNA Elution solution 到吸附柱;

l. 室温10,000 × g 离心2min;获取的洗脱液即为CHIP居品。可成功用于后续qPCR或测序(明慧:进行qPCR检测时需按等体积参预)

5. qPCR检测

a. 将Mix在4℃下融解,柔顺地凹凸倒置混匀并进行片晌离心;

b. 冰上配制下表中的反映液

身分 加入量 终浓度

HieffTM qPCR SYBR® Green Master Mix (low Rox) 5μL 1×

Forward Primer (10μM) 0.2μL 0.2 μM

Reverse Primer (10μM) 0.2μL 0.2 μM

DNA 2μL

RNase-free Water to 10μL

c. 将反映管进行片晌离心,确保总计反映液在反映孔底部。

d. 聘任三步法程序进行反映:

轮回数 关节 温度 时期 荧光采集

1 预变性 95℃ 5min No

40 变性 95℃ 10s No

退火 60℃ 30s Yes

上述反映放胆后,从60℃~95℃过程中进行融解弧线分析

四、期间上风

高特异性:聘任高亲和力抗体与优化的免疫千里淀决策,灵验缩小布景杂音。

高聪慧度:衔尾SYBR Green荧光检测系统,竣事低拷贝DNA序列的精准放大与检测。

强可视化数据:电泳图、qPCR柱状图等后果明晰直不雅,便捷数据深刻注解与发布。

可拓展性强:CHIP居品可成功用于qPCR、测序(CHIP-seq)等多种卑劣应用。

五、适用鸿沟

1️⃣转录因子-DNA衔尾位点筛查

2️⃣染色质修饰与表不雅遗传商榷

3️⃣基因抒发调控机制商榷

4️⃣药物作用机制探索

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六、代表性现实后果

CHIP-qPCR柱状图:直不雅展现HIF1A卵白在筹备区域的衔尾强度。

抗体考证与电泳图:考证抗体特异性与片断化进度,为现实数据添砖加瓦。

注:1、如ChIP放胆后进行检测伦理电影在线观看,input手脚对照;如放胆后进行q-PCR,则需要提供揣度靶基因衔尾位点的具体序列或筹备靶基因的称呼、序列或GeneBank ID。